Sexo Seguro

Hola, tengo una duda que espero me la puedan resolver, el dia 5 de junio del 2018 tuve relaciones con mi pareja, no somos sexualmente activos y su periodo no es regular, ahora bien, durante el acto sexual yo use condon en todo momento, y acabando lo inflamos y no tenia ningun orificio por el cual existiera fuga. Le llego su periodo el dia 14 del mismo mes, cuando le debia llegar y le duro sus 4 dias respectivos. Ya pasaron 40 dias de la ultima vez que le llegó el periodo y en todo ese tiempo no hemos tenido contacto sexual, está inflamada del vientre y estomago y a tenido una gran cantidad de altibajos (mas bajos) emocionales, quisiera saber porque se le ha retrasado tanto y cual es o son los riesgos, gracias.